Музей Маннергейма развивает сотрудничество с аналогичными музеями, другими организациями, а также поддерживает контакты с музейной и исследовательской средой. В работе отражается академический опыт, а в задачи входит многостороннее исследование темы Маннергейма и предоставление различных услуг как для широкой публики, так и для специальных гостей музея. Музей налаживает связь между обширным интересом в Финляндии к популярной истории, которая олицетворяется личностью маршала, и областью профессиональных исторических исследований.
Среди партнеров музея есть партнеры фонда – университет Хельсинки, Дворянское собрание и Силы обороны – а также другие организации, такие как Министерство иностранных дел, Красный Крест Финляндии и Национальный архив. Среди иностранных дипломатических миссий в Хельсинки, музей сотрудничал с посольствами Польши, Великобритании, Швеции, Швейцарии, Болгарии, Румынии, Франции и России. У музея были совместные проекты с финскими культурными учреждениями, Хельсинкской книжной ярмаркой и многими музыкантами. Многие другие организации, связанные с именем Маннергейма, такие как Фонд наследия маршала Финляндии Маннергейма и Фонд рыцарей креста Маннергейма, сохраняют память о Маннергейме в сотрудничестве с музеем.
Из коммерческих предприятий, особенно Oy Karl Fazer Ab поддерживали работу музея, но также поддержку оказывали Graaf Oy, Agency Leroy, Edrington Finland, Dan Ward – Runebergin Kukka, Boknäs, Genelec и Redbev. Отечественные музеи, с которыми музей Маннергейма в последнее время сотрудничал, включают в себя Национальный музей, музей Militaria, музей Галлен-Каллела, Тамминиеми, Айнола и дом Рунеберга.